Glitches zijn meestal weinig goed, maar soms juichen we ze toch toe. Zo zijn wel zeer blij te melden dat de oude glitches uit Pokémon Blue, Red en Yellow nog altijd aanwezig zijn in de Virtual Console versies.
Zo hebben enkele vroege spelers alvast ontdekt, zij vonden bijvoorbeeld de ontbrekende Pokémon MissingNo terug in Pokémon Blue en Red. Deze MissingNo had alvast grote voordelen, met deze Pokémon kun je onder andere zeldzame items als de Master Ball dupliceren. MissingNo - voorkomend in vijf verschillende vormen - is echter maar één van vele glitches. Zo zijn er manieren om vroeger toegang te krijgen tot Mewtwo en zelfs om een Mew te ontdekken. Het geeft alvast meer zin om de game opnieuw te gaan spelen.