Miitopia dient gered te worden en dus komen de Mii karakters tezamen om hiervoor te zorgen. Het doel van de speler is om een team Mii's aan te sturen in hun opdracht om de Dark Lord te verslaan en de gestolen gezichten van de Miitopia bevolking terug te vinden.
Belangrijk is om de relaties binnen het gezelschap goed te houden, anders kunnen ze weleens onenigheid krijgen over voedsel, slaap en zelfs combat. Terwijl je de wereld verkend kunnen vijanden je namelijk aanvallen, iets wat in een traditionele RPG stijl plaats zal vinden. Verder zijn er diverse aanpassingsopties, zo kun je sommige Amiibo figuren gebruiken om extra kostuums mee te verkrijgen, terwijl andere je extra tickets geven om mini-games mee te kunnen spelen in de arcade.
Nadat Miitopia afgelopen december in Japan verscheen heeft Nintendo nu bekend gemaakt dat het spel later dit jaar ook in Europa zal verschijnen.