De wereld van Ghost Squad is volledig in de handen van de terroristen, de Verenigde Naties hebben nog maar één redmiddel over: de Global Humanitarian-Operation and Special Tactics Squad of kortweg de Ghost Squad. Dit team bestaat uit vier mensen waarmee jij kunt spelen, het is de bedoeling om je door verschillende missies te werken met behulp van 25 wapens. Ghost Squad voor de Wii is een port van de arcadegame die twee jaar geleden werd uitgebracht.